| 一般 | 大 | 高 | 中 | 学 | 氏名 | 所属 | タイム | 大会名 | 月日 |
| 学年 | 場所 |
| 1 | | 1 | | | 池田裕二郎 | ベスト熊本 | 4:17.34 | 第48回日本短水路選手権水泳競技大会 | 2007/03/03 |
| 高校3 | 東京辰巳国際水泳場 |
| 2 | | 2 | | | 上野 公志 | 九州学院高校 | 4:24.34 | 平成18年度 第13回熊本県春季選手権水泳競技大会 | 2007/01/13 |
| 高校3 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと２５ｍ） |
| 3 | | 3 | | | 笹本 風吹 | 九州学院高校 | 4:46.27 | 平成18年度 第13回熊本県春季選手権水泳競技大会 | 2007/01/13 |
| 高校1 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと２５ｍ） |
| 4 | | 4 | | | 米満 惣平 | 九州学院高校 | 4:52.54 | 平成18年度 第13回熊本県春季選手権水泳競技大会 | 2007/01/13 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと２５ｍ） |
| 5 | | 5 | | | 米満 惣平 | 九州学院高校 | 4:55.49 | 第１２回冬季短水路公認記録会 | 2006/12/10 |
| 高校1 | 福岡市立総合西市民プール |
| 6 | | | 1 | | 奥田龍志郎 | ＪＡＳＳ八代 | 4:55.49 | 平成18年度 第13回熊本県春季選手権水泳競技大会 | 2007/01/13 |
| 中学1 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと２５ｍ） |
| 7 | | | 2 | | 今村 知哉 | 熊・ベスト熊本 | 4:56.91 | 大分・熊本県ジュニア対抗水泳大会 | 2007/01/28 |
| 中学2 | 佐伯市民総合プール |
| 8 | | | 3 | | 谷口 智律 | 熊・はるおか大江 | 4:59.66 | 大分・熊本県ジュニア対抗水泳大会 | 2007/01/28 |
| 中学2 | 佐伯市民総合プール |
| 9 | | | 4 | | 吉野 道久 | 熊・アレスト八代 | 4:59.74 | 大分・熊本県ジュニア対抗水泳大会 | 2007/01/28 |
| 中学2 | 佐伯市民総合プール |
| 10 | | 6 | | | 高松 良輔 | 鎮西高校 | 5:11.68 | 平成18年度 第13回熊本県春季選手権水泳競技大会 | 2007/01/13 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと２５ｍ） |
| 11 | | | 5 | | 井上 大暉 | マリーン菊池 | 5:23.22 | 平成18年度 第13回熊本県春季選手権水泳競技大会 | 2007/01/13 |
| 中学2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと２５ｍ） |
| 12 | | | 6 | | 佐和田海真 | ベスト熊本 | 5:25.41 | 第14回ベストチャンピオンシップ水泳競技大会 | 2006/11/19 |
| 中学1 | 福岡市西市民プール |
| 13 | | 7 | | | 木下淳一郎 | 秀岳館高校 | 5:38.56 | 平成18年度 第13回熊本県春季選手権水泳競技大会 | 2007/01/13 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと２５ｍ） |
