| 一般 | 大 | 高 | 中 | 学 | 氏名 | 所属 | タイム | 大会名 | 月日 |
| 学年 | 場所 |
| 1 | | 1 | | | 大賀 貴嗣 | 熊 本 | 2:02.31 | 第61回国民体育大会 水泳競技 | 2006/10/02 |
| 高校2 | 尼崎の森中央緑地スポーツ健康増進施設 |
| 2 | | 2 | | | 本郷 雄三 | ベスト熊本 | 2:07.21 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 3 | | 3 | | | 今村 和貴 | 九州学院高校 | 2:08.74 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 4 | | 4 | | | 小松 慎司 | ﾙｰﾃﾙ学院高校 | 2:09.99 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 5 | | 5 | | | 飯干 真也 | 九州学院高校 | 2:10.37 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校2 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 6 | | 6 | | | 尾方 大介 | 鎮西 | 2:11.86 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 7 | | 7 | | | 豊岡 太成 | 菊池 | 2:12.11 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校3 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 8 | | 8 | | | 嶋田 成政 | 秀岳館高校 | 2:13.58 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 9 | | 9 | | | 東 健太 | 九州学院高校 | 2:13.87 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 10 | | | 1 | | 山田 雄輝 | ﾙｰﾃﾙ学院中学 | 2:14.02 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学3 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 11 | | | 2 | | 竹盛 潤一 | 流泳館西部 | 2:15.10 | 第38回九州ジュニア水泳競技大会 | 2006/09/23 |
| 中学3 | 長崎市民総合プール |
| 12 | | | 3 | | 今田 優 | はるおか大江 | 2:15.32 | 第38回九州ジュニア水泳競技大会 | 2006/09/23 |
| 中学1 | 長崎市民総合プール |
| 13 | | 10 | | | 辻 龍之介 | 鎮西高校 | 2:16.54 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 14 | | 11 | | | 川本 哲朗 | 秀岳館高校 | 2:16.84 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 15 | | 12 | | | 中川 祐一 | 九州学院 | 2:17.04 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 16 | | | 4 | | 小松 正敬 | 八代第四中学 | 2:17.68 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学3 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 17 | | | 5 | | 下田 康介 | はるおか熊本 | 2:20.29 | 平成18年度 第27回熊本県ジュニア水泳競技大会 | 2006/06/04 |
| 中学3 | アクアドーム熊本 |
| 18 | | | 6 | | 中山 大輔 | 高森中学 | 2:20.41 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学3 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 19 | | 13 | | | 栄 悠佑 | 鎮西 | 2:20.45 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 20 | | | 7 | | 福島竜太朗 | 荒尾水泳教室 | 2:21.11 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 21 | | 14 | | | 的石 賢樹 | 球磨工業高校 | 2:21.35 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 22 | | | 8 | | 原本英太郎 | 竜南中学 | 2:29.46 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 23 | | | 9 | | 藤本 寛大 | 流泳館西部 | 2:30.10 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 24 | | | 10 | | 松永 大誠 | 西山中学 | 2:31.76 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 25 | | | 11 | | 猿渡 悠生 | アレスト八代 | 2:35.23 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 26 | | | 12 | | 斉藤 和輝 | 菊池南中学 | 2:38.04 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 27 | | | 13 | | 橋口真之亮 | 宇土鶴城中学 | 2:38.18 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学3 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 28 | | 15 | | | 宮本 大輝 | 済々黌 | 2:46.21 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校3 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 29 | | 16 | | | 山本 崇弘 | 八代高専 | 2:53.42 | 第41回全国高等専門学校体育大会 | 2006/08/06 |
| 高校2 | 神戸ポートアイランドスポーツセンター |
| 30 | | 17 | | | 吉冨 貴宏 | 八代高専 | 2:59.42 | 第41回全国高等専門学校体育大会 | 2006/08/06 |
| 高校5 | 神戸ポートアイランドスポーツセンター |
