| 一般 | 大 | 高 | 中 | 学 | 氏名 | 所属 | タイム | 大会名 | 月日 |
| 学年 | 場所 |
| 1 | | 1 | | | 山口 朝矢 | 熊 本 | 2:24.99 | 第61回国民体育大会 水泳競技 | 2006/10/01 |
| 高校1 | 尼崎の森中央緑地スポーツ健康増進施設 |
| 2 | | 2 | | | 池田裕二郎 | 九州学院高校 | 2:25.43 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 3 | | 3 | | | 猿渡 健生 | 八代 | 2:28.75 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校3 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 4 | | | 1 | | 水本 達也 | 荒尾水泳教室 | 2:31.65 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 5 | | | 2 | | 坂野 栄信 | 出水中学 | 2:32.16 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学3 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 6 | | 4 | | | 瀬崎 岳 | 九州学院 | 2:32.31 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校3 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 7 | | | 3 | | 米満 勇佑 | 流泳館西部 | 2:36.43 | 第38回九州ジュニア水泳競技大会 | 2006/09/23 |
| 中学2 | 長崎市民総合プール |
| 8 | | 5 | | | 佐藤 守 | 九州学院高校 | 2:36.96 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 9 | | | 4 | | 前田 宗 | アレスト八代 | 2:37.51 | 平成18年度 第27回熊本県ジュニア水泳競技大会 | 2006/06/04 |
| 中学3 | アクアドーム熊本 |
| 10 | | 6 | | | 斎藤 理史 | 鎮西 | 2:37.62 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校1 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 11 | | | 5 | | 松浦 佑紀 | アレスト八代 | 2:39.49 | 第38回九州ジュニア水泳競技大会 | 2006/09/23 |
| 中学1 | 長崎市民総合プール |
| 12 | | 7 | | | 松浦 竜弥 | 八代高専 | 2:39.50 | 第41回全国高等専門学校体育大会 | 2006/08/06 |
| 高校1 | 神戸ポートアイランドスポーツセンター |
| 13 | | 8 | | | 園田 朋彦 | マリスト学園 | 2:39.51 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 14 | | | 6 | | 植松 知哉 | 鹿南中学 | 2:40.14 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 15 | | 9 | | | 大里 卓也 | 熊本西 | 2:40.42 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校1 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 16 | | | 7 | | 西浦 諒 | ベスト熊本 | 2:41.25 | 平成18年度 第27回熊本県ジュニア水泳競技大会 | 2006/06/04 |
| 中学2 | アクアドーム熊本 |
| 17 | | 10 | | | 辻 久仁彦 | 九州学院 | 2:41.43 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 18 | | | 8 | | 吉野 道久 | 八代第三中学 | 2:43.63 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 19 | | 11 | | | 松本 和也 | 八代高校 | 2:43.71 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校2 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 20 | | | 9 | | 村本 翔哉 | 山鹿中学 | 2:43.74 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 21 | | | 10 | | 中村 圭佑 | 力合中学 | 2:47.83 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 22 | | | 11 | | 一美 拓利 | ＪＡＳＳ八代 | 2:47.98 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 23 | | | 12 | | 森田 祐稀 | ＪＡＳＳ八代 | 2:48.06 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 24 | | | 13 | | 猿渡 悠生 | アレスト八代 | 2:48.58 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学3 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 25 | | | 14 | | 金子 雄史 | はるおか大江 | 2:48.67 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 26 | | | 15 | | 楠田 賢斗 | 九州学院ＳＣ | 2:49.79 | 平成18年度 第27回熊本県ジュニア水泳競技大会 | 2006/06/04 |
| 中学2 | アクアドーム熊本 |
| 27 | | 12 | | | 冨永 一鷹 | 熊本北高校 | 2:50.90 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 28 | | 13 | | | 梶原 僚 | 荒尾高校 | 2:51.76 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 29 | | | 16 | | 豊田 誠弥 | 三和中学 | 2:52.97 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学3 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 30 | | | 17 | | 藤本 瑞希 | 矢部中学 | 2:53.05 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 31 | | | | 1 | 林田 公威 | 流泳館西部 | 2:53.23 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 小学6 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 32 | | 14 | | | 岡本 卓巳 | 熊本 | 2:53.44 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 33 | | | 18 | | 岡本 雄樹 | はるおか大江 | 2:53.53 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 34 | | | 19 | | 中村 亮太 | 流泳館西部 | 2:53.59 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学2 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 35 | | | 20 | | 田中 翔太 | 菊池ＳＳ | 2:54.26 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学2 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 36 | | 15 | | | 田中 伴茂 | 真和 | 2:54.92 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 37 | | | | | 上船 史弥 | 出水中学 | 2:55.74 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学2 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 38 | | 16 | | | 尾方 宏光 | 国立八代高専 | 2:56.07 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校3 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 39 | | 17 | | | 中神 一広 | 球磨工業高校 | 2:56.26 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校2 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 40 | | | | | 中山 大地 | アゼリア２１ | 2:56.70 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学2 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 41 | | 18 | | | 木下 徹 | 玉名 | 2:56.79 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 42 | | 19 | | | 戸坂 翔吾 | 熊本西 | 2:56.93 | 平成18年度 熊本県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/03 |
| 高校2 | 熊本市総合屋内プール(アクアドームくまもと) |
| 43 | | | | | 田嶋 達彦 | 西山中学 | 2:57.36 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学2 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 44 | | 20 | | | 隈部 恭平 | 人吉高校 | 2:59.85 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校2 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 45 | | | | | 霍田 浩樹 | 菊池ＳＳ | 2:59.92 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学2 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 46 | | | | | 相川 尚也 | 山鹿中学 | 3:00.18 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学3 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 47 | | | | | 池辺 貴昭 | 菊池高校 | 3:00.85 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 高校2 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 48 | | | | | 西本 輝 | 城西中学 | 3:01.43 | 平成18年度 熊本県中学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/07/30 |
| 中学1 | 熊本市総合屋内プール（アクアドームくまもと 50m） |
| 49 | | | | | 谷口 和広 | ＪＡＳＳ八代 | 3:01.77 | 平成18年度 熊本県選手権水泳競技大会 | 2006/08/05 |
| 中学1 | アクアドームくまもと（５０ｍ） |
| 50 | | | | | 山川 崇寛 | ＮｅｏＷＳＣ | 3:02.02 | 平成18年度 第27回熊本県ジュニア水泳競技大会 | 2006/06/04 |
| 中学3 | アクアドーム熊本 |
