| 一般 | 大 | 高 | 中 | 学 | 氏名 | 所属 | タイム | 大会名 | 月日 |
| 学年 | 場所 |
| 1 | | 1 | | | 今井 聡士 | 新 潟 | 4:02.40 | 第61回国民体育大会 水泳競技 | 2006/10/01 |
| 高校2 | 尼崎の森中央緑地スポーツ健康増進施設 |
| 2 | | 2 | | | 高橋 寿弥 | 長岡大手 | 4:05.40 | 第29回 全国JOCｼﾞｭﾆｱｵﾘﾝﾋﾟｯｸｶｯﾌﾟ夏季水泳競技大会 | 2006/08/29 |
| 高校3 | 東京・辰巳国際水泳場 |
| 3 | | 3 | | | 小林 頌之 | 巻 | 4:08.82 | 第59回 新潟県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/23 |
| 高校2 | |
| 4 | | 4 | | | 樋口 裕也 | 長岡大手 | 4:09.55 | 第59回 新潟県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/23 |
| 高校3 | |
| 5 | | | 1 | | 蝶名林新也 | 三条市立第二 | 4:15.17 | 第４６回全国中学校水泳競技大会 | 2006/08/23 |
| 中学3 | くろしおアリーナ |
| 6 | | 5 | | | 永井 耀 | 日本文理 | 4:15.90 | 第３９回北信越高等学校選手権水泳競技大会 | 2006/07/21 |
| 高校1 | アクアウイング |
| 7 | | 6 | | | 北川 直弥 | 日本文理 | 4:16.44 | 第59回 新潟県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/23 |
| 高校2 | |
| 8 | | | 2 | | 藤井 直輝 | 佐渡市立金井 | 4:16.48 | 第４６回全国中学校水泳競技大会 | 2006/08/23 |
| 中学3 | くろしおアリーナ |
| 9 | | 7 | | | 長谷川一幾 | 日本文理 | 4:19.01 | 新潟県高等学校春季地区体育大会 | 2006/05/30 |
| 高校3 | ウェルサンピア新潟 |
| 10 | | 8 | | | 村山 孝典 | 中越 | 4:20.55 | 第３９回北信越高等学校選手権水泳競技大会 | 2006/07/21 |
| 高校3 | アクアウイング |
| 11 | | 9 | | | 坂井 大希 | サンマリーン | 4:23.91 | 第17回新潟県スイミングクラブ協会クラブ対抗大会 | 2006/05/28 |
| 高校2 | 柏崎アクアパーク |
| 12 | | 10 | | | 瀬下 健 | 八海 | 4:24.47 | 第59回 新潟県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/23 |
| 高校1 | |
| 13 | | 11 | | | 須藤 拓馬 | ＪＰＥＣ新津 | 4:24.82 | 第17回新潟県スイミングクラブ協会クラブ対抗大会 | 2006/05/28 |
| 高校1 | 柏崎アクアパーク |
| 14 | | 12 | | | 田中 光 | 悠久ＳＣ | 4:25.48 | 第３８回東京スイミングセンタージュニア優秀選手招待 | 2006/11/23 |
| 高校1 | |
| 15 | | | 3 | | 村山 訓亮 | 柏崎東 | 4:27.20 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学2 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 16 | | 13 | | | 五十嵐翔一 | 長岡大手 | 4:27.75 | 第１８回新潟県高等学校秋季体育大会水泳競技大会 | 2006/09/12 |
| 高校2 | 柏崎アクアパークプール |
| 17 | | 14 | | | 澤谷 勇太 | 長岡 | 4:27.87 | 第１８回新潟県高等学校秋季体育大会水泳競技大会 | 2006/09/12 |
| 高校2 | 柏崎アクアパークプール |
| 18 | | | 4 | | 小菅 侑 | ＪＳジャンボ | 4:28.09 | 第29回 全国JOCｼﾞｭﾆｱｵﾘﾝﾋﾟｯｸｶｯﾌﾟ夏季水泳競技大会 | 2006/08/29 |
| 中学2 | 東京・辰巳国際水泳場 |
| 19 | | 15 | | | 柳沢慎太郎 | 高田 | 4:30.01 | 第１８回新潟県高等学校秋季体育大会水泳競技大会 | 2006/09/12 |
| 高校2 | 柏崎アクアパークプール |
| 20 | | | 5 | | 南雲 瞬希 | 十日町南 | 4:31.19 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学1 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 21 | | | 6 | | 相場 雄大 | 燕 | 4:31.54 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学3 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 22 | | 16 | | | 野沢 幸奨 | 悠久ＳＣ | 4:32.62 | 第３８回東京スイミングセンタージュニア優秀選手招待 | 2006/11/23 |
| 高校2 | |
| 23 | | | 7 | | 長谷 真宏 | 佐渡ＳＣ | 4:32.81 | 第６１回 国民体育大会水泳競技大会新潟県予選会 | 2006/07/30 |
| 中学3 | 新潟県長岡市悠久山プール |
| 24 | | | 8 | | 箱田 乾次 | 分水 | 4:34.06 | 平成１８年度 下越地区総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/12 |
| 中学2 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 25 | | | 9 | | 米持 龍 | 新井 | 4:34.84 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学2 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 26 | | | 10 | | 堀川 大輔 | 亀田西 | 4:36.15 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学3 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 27 | | | 11 | | 渡辺 勝 | 内野 | 4:36.59 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学2 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 28 | | | 12 | | 高柳 充央 | 吉田 | 4:38.58 | 平成１８年度 下越地区総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/12 |
| 中学3 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 29 | | 17 | | | 河原 邦将 | 新潟江南 | 4:39.96 | 新潟県高等学校春季地区体育大会 | 2006/05/30 |
| 高校1 | ウェルサンピア新潟 |
| 30 | | | 13 | | 樋山 光 | ＨＰカメダ | 4:40.54 | 第３８回東京スイミングセンタージュニア優秀選手招待 | 2006/11/23 |
| 中学2 | |
| 31 | | | 14 | | 大澤 英 | 新潟大江山 | 4:40.69 | 平成１８年度 新潟市中学校水泳競技大会 | 2006/06/13 |
| 中学3 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 32 | | | 15 | | 木澤 勝夫 | 上越正和ＳＳ | 4:42.03 | 第17回新潟県スイミングクラブ協会クラブ対抗大会 | 2006/05/28 |
| 中学3 | 柏崎アクアパーク |
| 33 | | 18 | | | 吉田 雄太 | 新潟西 | 4:42.91 | 第59回 新潟県高等学校総合体育大会水泳競技大会 | 2006/06/23 |
| 高校1 | |
| 34 | | 19 | | | 笹川 裕馬 | 日本文理 | 4:43.32 | 第１８回新潟県高等学校秋季体育大会水泳競技大会 | 2006/09/12 |
| 高校1 | 柏崎アクアパークプール |
| 35 | | | 16 | | 堀田健一郎 | 柏崎翔洋 | 4:43.38 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学1 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 36 | | 20 | | | 小林 哲平 | 上越総合技術 | 4:43.41 | 第１８回新潟県高等学校秋季体育大会水泳競技大会 | 2006/09/12 |
| 高校1 | 柏崎アクアパークプール |
| 37 | | | 17 | | 栗林 太郎 | 鏡が沖 | 4:43.42 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学2 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 38 | | | 18 | | 小笠原 颯 | ＪＳＳ長岡 | 4:44.33 | 第17回新潟県スイミングクラブ協会クラブ対抗大会 | 2006/05/28 |
| 中学3 | 柏崎アクアパーク |
| 39 | | | | | 佐藤 圭介 | アクシー巻 | 4:44.40 | 第６１回 国民体育大会水泳競技大会新潟県予選会 | 2006/07/30 |
| 高校1 | 新潟県長岡市悠久山プール |
| 40 | | | | | 鈴木 貴之 | ＡＣ三条 | 4:45.61 | 第17回新潟県スイミングクラブ協会クラブ対抗大会 | 2006/05/28 |
| 高校1 | 柏崎アクアパーク |
| 41 | | | 19 | | 小林 昂祐 | 春日 | 4:46.42 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学2 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 42 | | | 20 | | 塩原 滉平 | 五泉北 | 4:47.22 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学2 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 43 | | | | | 池田 智也 | 松之山 | 4:47.87 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学1 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 44 | | | | | 鳥部 駿介 | 燕 | 4:48.25 | 平成１８年度 下越地区総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/12 |
| 中学2 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 45 | | | | | 山崎 恭平 | 附属長岡 | 4:48.55 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学1 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 46 | | | | | 園部 敬祐 | Ｔ＆Ｓ新発田 | 4:48.88 | 第６１回 国民体育大会水泳競技大会新潟県予選会 | 2006/07/30 |
| 高校1 | 新潟県長岡市悠久山プール |
| 47 | | | | | 中村 俊貴 | サンマリーン | 4:50.04 | 第６１回 国民体育大会水泳競技大会新潟県予選会 | 2006/07/30 |
| 中学3 | 新潟県長岡市悠久山プール |
| 48 | | | | | 吉田 和史 | 長岡宮内 | 4:50.93 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学1 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 49 | | | | | 上野翔太郎 | 附属長岡 | 4:51.34 | 第３７回 新潟県中学校総合体育大会 水泳競技 | 2006/07/26 |
| 中学2 | 新潟市西海岸公園市営プール |
| 50 | | | | | 成海 恵一 | ダッシュ新潟 | 4:52.35 | 第６１回 国民体育大会水泳競技大会新潟県予選会 | 2006/07/30 |
| 中学3 | 新潟県長岡市悠久山プール |
| | | | | 1 | 中野 康平 | 新潟巻西 | 5:35.67 | 平成１８年度 新潟市中学校水泳競技大会 | 2006/06/13 |
| 小学1 | 新潟市西海岸公園市営プール |
